MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 53188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021082	TA	3	6	130731	130736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021082	CAA	2	6	130747	130752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_021082	T	6	6	130793	130798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_021082	TAAACT	2	12	130804	130815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2505	NC_021082	AAT	2	6	130858	130863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_021082	TTAT	2	8	130952	130959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_021082	T	6	6	131062	131067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_021082	CTT	2	6	131235	131240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884838
2509	NC_021082	CAA	2	6	131316	131321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884838
2510	NC_021082	TTTA	2	8	131371	131378	25 %	75 %	0 %	0 %	482884838
2511	NC_021082	ATG	2	6	131464	131469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884838
2512	NC_021082	TACC	2	8	131523	131530	25 %	25 %	0 %	50 %	482884838
2513	NC_021082	TAG	2	6	131696	131701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_021082	CAAA	2	8	131793	131800	75 %	0 %	0 %	25 %	482884839
2515	NC_021082	CTG	3	9	131883	131891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884839
2516	NC_021082	CAC	2	6	131917	131922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884839
2517	NC_021082	ATC	2	6	131990	131995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884839
2518	NC_021082	TTTC	2	8	132030	132037	0 %	75 %	0 %	25 %	482884839
2519	NC_021082	CAT	2	6	132075	132080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884839
2520	NC_021082	CACC	2	8	132099	132106	25 %	0 %	0 %	75 %	482884839
2521	NC_021082	TAAA	2	8	132199	132206	75 %	25 %	0 %	0 %	482884839
2522	NC_021082	CAG	2	6	132286	132291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884839
2523	NC_021082	AAT	2	6	132361	132366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884839
2524	NC_021082	AAT	2	6	132394	132399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884839
2525	NC_021082	A	6	6	132503	132508	100 %	0 %	0 %	0 %	482884839
2526	NC_021082	TTGC	2	8	132558	132565	0 %	50 %	25 %	25 %	482884839
2527	NC_021082	CTG	2	6	132586	132591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884839
2528	NC_021082	CTTT	2	8	132604	132611	0 %	75 %	0 %	25 %	482884840
2529	NC_021082	CAA	2	6	132634	132639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884840
2530	NC_021082	CAC	2	6	132646	132651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884840
2531	NC_021082	GAGC	2	8	132726	132733	25 %	0 %	50 %	25 %	482884840
2532	NC_021082	CTT	2	6	132741	132746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884840
2533	NC_021082	TAT	2	6	132750	132755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884840
2534	NC_021082	CCAAA	2	10	132822	132831	60 %	0 %	0 %	40 %	482884840
2535	NC_021082	CGG	2	6	132833	132838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884840
2536	NC_021082	ATA	2	6	133061	133066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884840
2537	NC_021082	TTG	2	6	133070	133075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884840
2538	NC_021082	GCC	2	6	133175	133180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884840
2539	NC_021082	CAA	2	6	133258	133263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884840
2540	NC_021082	A	6	6	133322	133327	100 %	0 %	0 %	0 %	482884840
2541	NC_021082	CAC	2	6	133369	133374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884840
2542	NC_021082	CAG	2	6	133378	133383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884840
2543	NC_021082	A	6	6	133653	133658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021082	TAG	2	6	133659	133664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021082	A	6	6	133665	133670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_021082	A	7	7	133682	133688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_021082	TCTA	2	8	133713	133720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2548	NC_021082	TCT	2	6	133758	133763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884841
2549	NC_021082	ATAA	2	8	133782	133789	75 %	25 %	0 %	0 %	482884841
2550	NC_021082	GA	3	6	133809	133814	50 %	0 %	50 %	0 %	482884841
2551	NC_021082	AC	3	6	133945	133950	50 %	0 %	0 %	50 %	482884841
2552	NC_021082	CAT	2	6	133981	133986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884841
2553	NC_021082	TCT	2	6	133992	133997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884841
2554	NC_021082	TTG	2	6	134099	134104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884841
2555	NC_021082	CTT	2	6	134191	134196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884841
2556	NC_021082	TCT	2	6	134217	134222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884841
2557	NC_021082	TAA	2	6	134238	134243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_021082	ATT	2	6	134247	134252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884842
2559	NC_021082	T	6	6	134257	134262	0 %	100 %	0 %	0 %	482884842
2560	NC_021082	TGC	2	6	134278	134283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884842
2561	NC_021082	GCC	2	6	134290	134295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884842
2562	NC_021082	CTT	2	6	134301	134306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884842
2563	NC_021082	ACC	2	6	134356	134361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884842
2564	NC_021082	TGAAG	2	10	134362	134371	40 %	20 %	40 %	0 %	482884842
2565	NC_021082	CTA	2	6	134382	134387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884842
2566	NC_021082	TGAT	2	8	134420	134427	25 %	50 %	25 %	0 %	482884842
2567	NC_021082	GCT	2	6	134432	134437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884842
2568	NC_021082	AAT	2	6	134470	134475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884842
2569	NC_021082	TCA	2	6	134495	134500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884842
2570	NC_021082	ACT	2	6	134516	134521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884842
2571	NC_021082	CTT	2	6	134526	134531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884842
2572	NC_021082	CAAT	2	8	134613	134620	50 %	25 %	0 %	25 %	482884842
2573	NC_021082	A	6	6	134659	134664	100 %	0 %	0 %	0 %	482884842
2574	NC_021082	TTG	2	6	134674	134679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884842
2575	NC_021082	AGTT	2	8	134686	134693	25 %	50 %	25 %	0 %	482884842
2576	NC_021082	A	6	6	134721	134726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_021082	TAA	2	6	134779	134784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_021082	ATT	2	6	134815	134820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884843
2579	NC_021082	TTG	2	6	134825	134830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884843
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2581	NC_021082	CTTTCG	2	12	134869	134880	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482884843
2582	NC_021082	GTT	2	6	134977	134982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884843
2583	NC_021082	ATC	2	6	135006	135011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884843
2584	NC_021082	GAT	2	6	135053	135058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884843
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2591	NC_021082	CAT	2	6	135220	135225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884843
2592	NC_021082	TTC	2	6	135323	135328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884843
2593	NC_021082	T	6	6	135350	135355	0 %	100 %	0 %	0 %	482884843
2594	NC_021082	TCT	2	6	135390	135395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884843
2595	NC_021082	T	6	6	135398	135403	0 %	100 %	0 %	0 %	482884843
2596	NC_021082	GCT	2	6	135423	135428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884843
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2599	NC_021082	TTC	2	6	135587	135592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884843
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2602	NC_021082	TGGT	2	8	135818	135825	0 %	50 %	50 %	0 %	482884843
2603	NC_021082	GTT	2	6	135827	135832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884843
2604	NC_021082	T	6	6	135865	135870	0 %	100 %	0 %	0 %	482884843
2605	NC_021082	TCA	2	6	135906	135911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884843
2606	NC_021082	GTT	2	6	135946	135951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884843
2607	NC_021082	CTTTAC	2	12	135970	135981	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482884843
2608	NC_021082	TGC	2	6	136034	136039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884843
2609	NC_021082	A	6	6	136139	136144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_021082	GAA	2	6	136193	136198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_021082	A	6	6	136225	136230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_021082	T	6	6	136277	136282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_021082	AAATG	2	10	136296	136305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_021082	ATATG	2	10	136306	136315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_021082	TTTA	2	8	136376	136383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_021082	ATT	2	6	136410	136415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884844
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2618	NC_021082	ACC	2	6	136453	136458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884844
2619	NC_021082	TGT	2	6	136527	136532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884844
2620	NC_021082	GAA	2	6	136624	136629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884844
2621	NC_021082	GAC	2	6	136638	136643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884844
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2623	NC_021082	ATA	2	6	136659	136664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884844
2624	NC_021082	TG	4	8	136687	136694	0 %	50 %	50 %	0 %	482884844
2625	NC_021082	TTC	2	6	136738	136743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884844
2626	NC_021082	TAA	2	6	136759	136764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884844
2627	NC_021082	TAA	2	6	136798	136803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884844
2628	NC_021082	GTT	2	6	136832	136837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884844
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2631	NC_021082	TAC	2	6	136912	136917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884844
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2633	NC_021082	ATGT	2	8	136997	137004	25 %	50 %	25 %	0 %	482884844
2634	NC_021082	TCA	2	6	137096	137101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884844
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2646	NC_021082	ATT	2	6	137654	137659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884845
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2692	NC_021082	TTAAA	2	10	139783	139792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2693	NC_021082	TAA	2	6	139798	139803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2694	NC_021082	CTG	2	6	139927	139932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884846
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2715	NC_021082	A	6	6	140836	140841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2716	NC_021082	ATT	2	6	140854	140859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2718	NC_021082	AAC	2	6	140944	140949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2730	NC_021082	TTGGC	2	10	141592	141601	0 %	40 %	40 %	20 %	482884848
2731	NC_021082	CAT	2	6	141650	141655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884848
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2733	NC_021082	GTCT	2	8	141703	141710	0 %	50 %	25 %	25 %	482884848
2734	NC_021082	GCG	2	6	141732	141737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884848
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2740	NC_021082	T	7	7	141938	141944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2741	NC_021082	A	6	6	141947	141952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2742	NC_021082	CGG	2	6	142128	142133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884849
2743	NC_021082	GGTC	2	8	142149	142156	0 %	25 %	50 %	25 %	482884849
2744	NC_021082	TTTA	2	8	142176	142183	25 %	75 %	0 %	0 %	482884849
2745	NC_021082	TGC	2	6	142185	142190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884849
2746	NC_021082	CGG	2	6	142337	142342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884849
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2748	NC_021082	TCAA	2	8	142387	142394	50 %	25 %	0 %	25 %	482884849
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2998	NC_021082	TTAA	2	8	155039	155046	50 %	50 %	0 %	0 %	482884860
2999	NC_021082	ATA	2	6	155077	155082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884860
3000	NC_021082	ATA	2	6	155115	155120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884860

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